到放的但丁的后裔们也被召回佛罗萨。但丁放时，一直陷于极端的贫困之中。

与此同时，整个城市的面貌大为改观。女人们纷纷将她们富余的装饰品弃之如敝，转而简衣素。年轻人个个谦虚、谨慎。在中午休息时分，经常可以看到店主在他们的商店里研读《圣经》抑或萨沃那洛拉的一些作品。教堂里常常人满为患，那些穷困潦倒的人们免费得到施舍。最令人称奇的却是商人和银行家们受到德良知召而归还金钱，数额有时达数千弗罗林，这些金钱曾是他们通过巧取豪夺的不正当手段获得的。所有的这一切都是萨沃那洛拉个人人格魅力的衍生。

1495年四旬斋后，萨沃那洛拉疲力尽。因为忠诚地保持自己的斋戒，他过去一直吃的是营养很差的。他的床铺比其他人的都要，房间也少装饰。他曾经发过誓要与一切舒适的生活决裂，而且他以比对别人要求更严格的标准严以律己，因此他变得极其消瘦，力也明显不济。衰弱的力量因内疾病的侵袭而疯狂滋生。“但是，”维拉里说，“这位修士如此之不屈不挠的勇气，以致使他几乎从未停止作政治斗争。以前，他在约伯了一系列布，力衰弱反而增加了他的德威望。他的睛光芒四，虽然躯颤抖不已，而演讲却比以往任何时候更富激情且更切中时弊。”

布拉玛奇说过：“萨沃那洛拉曾经过一次极其令人敬畏而又发人省的布，这一布被逐句记下后呈送教皇。教皇看后非常愤慨，于是便召来一位与萨沃那洛拉级别相当的主教，这位主教是一个知识非常渊博的人，并对主教说：‘务必反击这一布，我希望你继续反驳这位修士（即萨沃那洛拉）。’主教回答说：‘我会这样的，圣父！但是，为了战胜他，我必须得有反驳他的手段。’‘什么手段？’教皇问。‘这位修士说，我们不应该有姘妇或鼓励买卖圣职。他说的是事实。’教皇回答说：‘那该怎样对付他呢？’主教说：‘奖赏他，和他朋友，授予他红衣主教职位。这样，他也许会放弃他的预言并收回他曾经说过的话。”’

1495年，佛罗萨一个支持埃罗的名叫“阿拉比亚提”谋俱乐曾威胁要暗杀萨沃那洛拉，他们认为暗杀这位修士后便可以结束共和制。基于此，一群全副武装的志愿者围着萨沃那洛拉，从大教堂一路陪同、护送他到圣·克修院。教皇波吉亚·亚历山大六世派人从罗送来了敕书，敕书勒令他暂停布，同时，敕书还指责他是一个虚伪教义的传播者。在他被剥夺了说话权利期间，“阿拉比亚提”组织却准备再度使狂节中猥亵的娱乐死灰复燃，使人们情横。萨沃那洛拉力图用“儿童的改造”阻止这一切。追随者的孩们排成一队，行在佛罗萨的大街小巷中。为了救济穷人，孩们为圣·克修院的修士们募捐。

教皇最后收回了成命，允许萨沃那洛拉像以往一样布。如果他肯在将来的布中改变措辞语调的话，愿意让他红衣主教。但萨沃那洛拉拒绝了教皇的此番“意”。翌日早晨，他在大教堂所的布中说：“我并不希罕红衣主教帽，也不希罕僧侣帽，不其是大是小。我希望的只是为正义而承诺给圣徒们的那东西——死亡。如果我贪图荣华富贵，现在就不会如此衣衫褴褛。我已好一切准备，为了职责而献生命。”

共和国的灾难接踵而至。在围攻比萨城期间，佛罗萨人于大混之中。大街上，公路旁，到可见饿得奄奄一息的穷人。那时，佛罗萨还爆发了一场瘟疫，瘟疫导致饥殍遍野，城乡一片荒凉凄惨。瘟疫也席卷了圣·克教堂。萨沃那洛拉将那些胆怯者和有病者送到乡下，自己却仍然和他的忠实信徒待在城中。在佛罗萨市，瘟疫每天要夺走大约100人的生命。而萨沃那洛拉却随时准备去那些遭受瘟疫肆横行的房屋，为垂死之人最后的祷告。约莫过了一个月，这场瘟疫才过去，但是，对共和国的谋却又开始在酝酿之中。