在武则天宣布留刘仁轨留守长安之时，刘仁轨生了一场小病，在府中静养，武则天亲自写了封信，让人转刘仁轨书：“昔汉以关中事委萧何，今托公亦犹是矣……”但刘仁轨上疏，以年老衰不能胜任留守职务推辞，并陈述汉朝吕后祸败的事实，以申明对太后的劝诫之意。

中书省、门下省的副长官也有变化，以魏玄同、刘祎之为中书侍郎。郭待举、刘贤齐为黄门侍郎。魏玄同是贺兰之最新向武则天举荐的人，这是他在近段时间发现才能非常不错的中级官吏，原本魏玄同得工尚书刘审礼荐举，任岐州刺史，随后转任中书舍人，贺兰之在与其接几次后，发现这个人才能不凡。而且生耿直，与张柬之有类似，因此在对其笼络的同时。大力向武则天举荐，此次终被被晋为中书侍郎。

贺兰之也不以为意。他喜这类耿直的人，讨厌见风使舵，阿谀奉迎之人。

自此以后，尚书左、右仆不需要再挂“同中书、门下三品”，也是当然的宰相，并且地位于侍中和中书令，尚书左仆再成为百官之首，是政事堂的最尊者，因为李贤、李显及诸王谋逆的事件，贺兰之成了百官之首，得武则天幸程度没人可以比，其地位尊崇程度也没人可以比。

书，李敬玄同为侍中，裴炎、崔知温为中书令，岑长倩为兵尚书、骆宾王为尚书、狄仁杰邢尚书、刘审礼为工尚书、张柬之为礼尚书

得贺兰之举荐而任职的还有另外一人，太学生魏元忠所写一篇陈述时政得失的文章。到贺兰之手里，他看了后非常称赞，呈给武则天看，得武则天的赏识，在贺兰之的大力荐举下，在这次官员变动中任郎中!只是这家伙升了官，也知是因贺兰之的举荐才升了官，并没表现与魏玄同那样，对贺兰之表示激，甚至都没到秦王府上来拜访。

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军方的一些将领职务也有调整，贺兰之不再兼任左羽林军大将军职，在他的推荐下。程务转任为检校左羽林军大将军，李多祚仍为右羽林军大将军，以黑齿常之为左金吾卫大将军、李孝逸为右金吾卫大将军。李孝逸是少数没有被波及的李唐宗室之一，他在这次事件中，因为“立场”定，一力支持武则天。得到嘉奖，被转授右金吾卫大将军职。

位列政事堂的宰相班列有九人，比原来的少了一人，除两位尚书仆及两位侍中、两位中书令是当然的宰相外，兵尚书岑长倩、刑尚书狄仁杰、尚书张柬之同领“同中书、门下三品”，位列政事堂，九位宰相中，大多是武则天的“亲信”了!

另外一些将领的任命为：薛仁贵为左卫大将军，李谨行改任左领军卫大将军，被召回朝的弓仁授以左武卫大将军，得武则天特别赐婚的薛讷被授以左羽林军将军职。刘冕和李敬猷仍然执掌左右千卫，对贺兰之态度有所转变的王方翼转任左卫大将军，依然兼任兵侍郎。

贺兰之闻言后大怒，当着贺兰之的面

长安的事平静下来，武则天依然照她早先制定的计划，准备去往东都洛，并改东都为神都。在她去往洛期间，皇帝李旦及文武百官俱随行，留尚书右仆刘仁轨为长安留守。