行政――辅助火影理木叶政务的机构，其最长官是作为原三代火影两位顾问的门炎和转寝小两位老师，他们的地位相当于村中的长老，行政的存在也是木叶的立法形式之一。一来是为了辅助火影工作给于一些正确的意见，二来是作为火之国与木叶的桥梁，传达国家的信息，及接受国家所拨给村的财政支，同时也向大名反应村的一些状况和形势。

尸理班――专门负责理死亡尸的单位，由于忍者的会透每个忍者村特有忍术的秘密和查克拉质，还有用过特殊药品成分的痕迹，所以为了保护这些情报必须有专业人员来负责工作，尸理班不但清理村内现的尸而且还定期向暗输送优秀人才，以帮助理一些本村逃忍的尸。（注：兜在于卡卡西一战时所使用的死魂术便是源于尸理班）

审讯（监狱？？）――正式名称为－木叶拷问审问－专门执行对被捕的敌国忍者（特别是细）及一些逃忍监控拷问的门，由于上述任务大多是有暗负责所以次门经常于暗连立，审问所得情报不透给机构与个人，直接于火影（次门的长便是那个满倒疤且有心理待倾向特别上忍―森乃伊比喜）

医疗――木叶原本的医疗并不发达，但由于三忍之一的纲手提的四人战斗小队中一名医疗忍者的历史方案使的木叶的医疗有了突飞猛的发展，时至今日已经可以分成急救医疗班，尸理班，驯兽兽疗养班等多个分支系统。

教育――木叶教育的主就是忍者学校了，这里是每一位忍者的摇篮之地，许多优秀的忍者就是从这里开始他们的忍者之路。在这里有每一位忍者的童年，也许是快乐的，也许是悲伤的，也许是烦恼的，也许艰辛的，酸甜苦辣充实着忍者的内心也充实着忧愁多的忍者学校，人们着这里的同学也着这里的老师（木那个白痴就当然排除啦）。这里曾经有着恶作剧的鸣人，漂亮的小樱，耍酷的佐助，努力的小李，冷漠的宁次，吵嘴的井野，吃的丁次，睡觉的牙，闲女人烦的鹿，极早毕业的鼬与卡卡西和在脸上挂条倒疤的依鲁卡。总之，这里有太多太多的回忆了~~~~~~~

木叶医院是医疗的大本营――其规模也是比较庞大的，一切医疗设备都相当完全，伙也不错（看丁次那个死胖每次院都能胖上几斤）环境也是一啊要是可以的话，我也真想到那里住上十天半个月啊。

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木叶警务（已亡）――木叶原本是有警务这个机构的，主要工作就是维持木叶内的制安和稳定，有时也协助暗参加村的防备工作。这个门自古都是有木叶的英一族宇智波

训兽疗养班――主要工作就是医治一些受伤的驯兽（赤那类）和（豚豚那类）的单位，成员大多都是兽医（牙的便是其成员，有可能是训兽疗养班的班长），由于驯兽大多都是和主人一起执行任务的受伤也是在所难免，所以训兽疗养班的存在也是非常必要的。

山这里可以俯看整个木叶，木叶有非常完善的制，我称之为火之系。木叶一共有六大门（已知的），这六大门运行着木叶的各项工作，使木叶充满着生机。

医疗急救班――主要负责医治因任务或事故而受重伤的忍者的单位，其成员都是擅长医疗忍术的英，执行任务时都穿着白的专用医疗服（就是中忍考试中的那些个抬担架的人，237话中医治宁次时也现过）许多升级为上忍的医疗忍者大多都是生于医疗急救班，而其班长便是兜的养父（看兜的实力就应该了解医疗班的悍了吧）。

暗――正式名称是：“暗杀战术特殊队”，类似于现在的特军队门，暗的成员都是从村里筛选的优秀忍者，主要行保护火影和预防外敌侵木叶忍者村的工作，有时还负责侦察敌情和暗杀等任务，其成员行动时都着模仿动的白面，任务质及其他一切资料均保密。暗由火影直属，一切命令由火影发布，队底下设多个分队，由分队长统一转达命令和领导执行任务。