大决斗!大木研究所

小智等人来到大木研究所，在那里遇到了小茂，众人一起顺便了解大木博士的研究生活。想要抢夺卡丘的火箭队这时又来捣，在研究所广大的院中迷路许久以后，他们终于遇上小智等人，可是双方还来不及大打手，火箭队二人一猫就被横冲直撞的一群肯泰罗给撞飞了!

67.当呆呆兽变成呆河的时候

为了解开大木博士苦思不解的疑惑，小智一行人来到了风光明媚的比努海岸。借着西野森教授所饲养的呆呆兽及武藏所收服的大贝，让大木博士等人解开这化之谜.

68.踏浪卡丘的传说

小智等人来到比努海岸特训，小智在中脚遇难时，幸好被川特与奎尔救起。这一人一卡丘的组合，背后有着人的故事。川特是否能战胜这20年一度的大海浪，为比努海岸创造一个的传说呢？

69.植园的臭臭

小智等人来到村雨植园，妙蛙在那里喜上臭臭，小刚在那里喜上园主林。林有个烦脑，为了继成家业，应该化的臭臭迟迟没化成霸王。刚好火箭队又来捣，在小刚的鼓励下，林拿她的臭臭应战...

70.神奇宝贝电影

南野导演为了拍摄由神奇宝贝们演的电影，所有的神奇宝贝均一一地跃上大屏幕，以胖可丁及可达鸭领衔主演的情剧，在火箭队及小智们一番对战下而闹闹地开拍着。

71.喵喵之歌

神奇宝贝电影即将于好来坞上映，大伙闹闹地来到这喵喵不堪回首的伤心地。昔日的喵喵为了得到佳人的芳心，努力地朝"人类"迈，学习人类讲话，学习人类走路，但仍是无法获得佳人芳心而只能独鸣悲歌。

72.四天王希场

为了习得四天王希的大绝技，小智们一同来到了山中；借着希替大岩蛇解除痛苦，而使得山中亦获得平静，让小智一行人了解到，与神奇宝贝们的心灵沟通更战斗收服来得更重要。

73.激烈冲突！超古代神奇宝贝！

小智等人在独立特训的时候，遇到神奇宝贝考古学权威，天才少女怀特博士。考古挖掘现场挖了超古代神奇宝贝的胡地与耿鬼，特大号的他们一闹起来，无人能挡，莫非世界就要毁灭了？

74.嘎啦嘎啦的骨

向神奇宝贝联盟迈的路上，遇见了被火箭队夺走徽章的斋藏及嘎啦嘎啦，小智一人更再次阻止火箭队的捣，顺利地将斋藏的徽章取回，更让斋藏及嘎啦嘎啦重修旧好。

75.开火！神奇宝贝联盟开会式

神奇宝贝联盟传递的圣火，竟然被火箭队给盗走了；失去了圣火因而无法举行开会仪式的达岚其会长，拿了火焰鸟的火苗，就在联盟即将展开之际，火箭队又再次地现了…

76.神奇宝贝联盟开幕！之场地

小智朝神奇宝贝大师迈的第一战：石英大会的之场地，以华丽战斗技巧的多武，派了椰树，海刺龙及大嘴蝠，均一一被小智的大钳蟹打败而取得了大胜利，小智的大钳蟹更化成了钳蟹…

77.冰之场地区！火炎之战

在第三场战斗之前，火箭队又利用巧妙的化妆术骗走了小智的卡丘，幸好小刚没有被武藏的伪装所迷惑，抢回了卡丘；与小正对战时，钳蟹反被风速狗的龙之怒绝技所打败，借着卡丘的十万伏特合着产生更大的威力，而小智更赢得了比赛，迎向第四回合的挑战